2021年结直肠癌分子检测高通量核酸中国专家共识发布,要点一览!

2021-12-20 02:40:08 来源:
分享:
在手腺癌在中会华民族的病症率红褐色逐年上升的趋势,世 界卫生该组织国际结核病研究课题机构(International Agency for Research on Cancer,IARC)数据揭示,中会华民族 2020 年在手直 胃癌的新病症例数为 56 万例,因在手腺癌丧生病例达 29 万例 。 约 25%的在手腺癌病人在治疗时已消失远 东南侧转移,此外,25%的病人在化疗操作过程中会牵涉到转移,中会叶 病人结节病极差,5 年生存率不足以 15%。 分子标志物员警 测出是审核靶向化疗获益人群的前纳,近年来随着员警查 新科技的飞速发展,高通存量基因组,也称为下一代基因组( next generation sequencing,NGS),因其在通存量、费用及效率 等各个方面的综合占优,在基因基因员警查中会展现出趋 来趋广阔的应将用前景。 然而 NGS 员警查新科技流程复杂, 对Laboratory环境状况、其他部门能力也及常为存量管理者要求高,任何 一个环节消失疑问,均会冲击员警查在手果的精确度,进而冲击临床决策。

为保的证临床诊疗工作的精确度和学术性,本共识由临床护士在手合在手腺癌亦非际诊疗需求号召,业内诸多员警查美国公司参予,临床及员警验专家监督,从在手腺癌 NGS 员警查的临床都与反及Laboratory流程常为控都与反共同起草我国专家共识,以监督 NGS 员警查新科技在在手腺癌诊疗中会的约束应将用。

1,海洋生物标志物在在手腺癌中会的临床意义

现今较明确的胃癌关的遗传病结核病主要有 3 类:Lynch 综合征、的王室性腺突起肉病 ( familial adenomatous polyposis,FAP)和黑斑水肿病(P⁃J 综合征)。 同时《我国临床学会 ( CSCO) 在手腺癌诊疗同义南 2020 版》 针对遗传病在手腺癌筛查和基因治疗制定了主张。

FAP 录用开展 APC 氨基酸基因组/片段缺失基因组,有基因纳示 FAP 或衰减型式 FAP(AFAP);无基因 则录用;大 MUTYH 氨基酸基因组 / 片段缺失基因组,有突 衰纳示 MUTYH 关的水肿病(MUTYH⁃associated pol⁃ yposis,MAP)。 对于无任何已知的水肿病综合征基因 的禽流感衰异,正因如此多基因基因员警查,多基因 Panel 应将包括所有水肿和在手腺癌关的基因。

在手腺癌中会典型式 TMB 判读方法有及员警查范城外汇总

TMB 员警查适度帮助审核免疫化疗潜在获 益的病人,突出大大纳高中会叶恶性病人的主观缓 解率和总生存期。 MSI⁃H/dMMR 往往也伴随 TMB⁃H,MSI⁃H 员警验中会有约 83%表现为 TMB⁃H,且有 97%的员警验 TMB≥10 Muts/ Mb。 在临床研究课题和亦非践操作过程中会,TMB 的同义标判读国际标准 在各不都与同癌种中会普遍存在差异,而各不都与同靶向基因组 Panel 的 TMB 员警查体系密布关系 TMB 阈值不能国际国际标准。

病人制定关的化疗方案的操作过程,在手合在手腺癌海洋生物标志物关的临床意义,自决定员警查作如下录用 :

2,员警验东南侧理及转运

FFPE 员警验为保的证核糖常为存量,手术后或员警查和

该组织应将在离体 30 min 内冰水到 100 ml 的 4%当季 酰胺溶液中会开展固定,能避免运用于酸性及含有重金属 水分子的固定液。 其中会,大标本固定一段时间为 6 ~ 48 h,不超过 72 h;小员警查和体可固定 6 ~ 12 h。 对 其中会 1 张 FFPE 员警验开展布片染料,并在显微镜 下掩蔽细胞膜的含存量和数存量。 若含存量不 足,则Laboratory能够对通过富含后符合常为存量要求的 标本开展同义标,或者制备成 FFPE 细胞膜学蜡块后 开展核糖萃取。 值得注意的是,开展 NGS 员警查前 应将通过 HE 染料同义标细胞膜含存量,至少依赖于肿 突起细胞膜含存量在 20%以上。

手术后或员警查和的好吃该组织员警验

好吃该组织可萃取到高常为存量的核糖。 好吃该组织应将在离体 30 min 内 将其保留于氟化氢罐或者-80 °C 冰盒中会,防止 RNA 等 核糖降解。 如需同义标细胞膜含存量,可使用再生布 片生殖细胞方法有,若细胞膜含存量不足以,可通过标记 区域开展富含。 好吃该组织可在氟化氢、-80 °C 冰 盒或稳定剂中会长期保留。

血浆员警验

对于普遍存在于血浆中会的循环 DNA, 即 ctDNA,取样时可运用于辅助的 ctDNA 保留管采血, 采血后轻盈颠倒 8 ~ 10 次,确保采肺部中会的 ctDNA 保留液与尿液充分混匀,常温转运保留即可,严禁 冻融尿液;驶向Laboratory后,受控血浆,萃取游离 DNA[26] 。 也可运用于一次性 EDTA 抗凝高热采肺部, 搜集 8 ~ 10 ml 全血,冷藏运剩,2 h 内受控血浆,纳 取游离 DNA,如需保留,请移到-80 °C 冰盒中会,并避 免反复冻融。

员警验运载约束

送国际标准可用约束( SOPs) 以确保运载操作过程中会各类样 本的安全性和操作过程的可控性(参阅第 4 节)。 石蜡 材料可以常温运剩,尿液员警验能够在干冰状况下运 剩,核糖员警验需在 4 °C或再生状况下运剩。

3,研究课题新报告解释及国际标准模板

NGS 临床研究课题新报告包含内容

基因员警查的临床新报 告应将当包括:(1)基础文档:Laboratory名称、考中验操 作其他部门、研究课题新报告审查其他部门、联系方式。 (2)受员警者的 基本文档:应将包括受员警者姓名、性别、出生日期、 接受员警查的日期、员警查的目的和受员警者的临床同义 征等。 (3)员警验的文档:员警验类型式,如 DNA、外周血、体液、好吃该组织、FFPE 该组织等;搜集一段时间和采 集部位、员警验编号、送员警一段时间、员警查研究课题新报告一段时间和样 本主要常为控情况,如 DNA 常为存量同义标以及基因组常为 存量同义标等。 (4)员警查自建设项目:基因 Panel 的员警查位 点及 员警 测出 范 城外、 员警 测出 仪 器、 员警 测出 考中 剂, 是 否 为 NMPA 批准运用于的员警查考中剂以及 NMPA 获批的 基因肽链文档,或Laboratory自自建员警查( laboratory de⁃ veloped tests,LDTs) 考中剂、员警查方法有、员警查范城外、员警 测出少于(LoD)等。 (5)员警查在手果及衰异解释:对 基因衰异的员警查在手果开展解释,如剔除的基因 型式、衰异在手果、生殖细胞衰化情况、员警查在手果的病毒性 性AO、药物文档及临床意义、衰异解释引用的 参阅文献等。 (6)标示出员警查方法有的Laboratory内部验 的证在手果,员警查局限性及不具体性,进一步员警查的 自决定。

基因衰异的名字

对基因衰异的揭示应将遵循 一定的主张和约束,录用运用于人类基因组衰异协会 名字同义南(www.hgvs.org),特异性本的选择自决定使用基因座参阅基因组序列数据库( Locus Reference Ge⁃ nomic, https:/ /www.lrg⁃sequence.org) 界定的特异性本或者多个国际数据库众所周知的主要特异性本。 对遗传病在手腺癌关的基因衰异的陈述,自决定以新泽西州自然科学遗传学学院( American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG;https:/ / www.acmg.net)同义南为国际标准,在员警查在手果中会列出具体内容的衰异肽链文档,包括基因名称、所参阅的人类基因组版本号、特异性本参阅序列版本号、多肽衰异、衰异、氨基酸 / 内含子序号、等位基因杂合性、生殖细胞编号及坐标等等。

临床意义的解释和语录

对于细胞分裂膜基因,使用AO东南侧理的方式 综合伴随治疗、临床同义南、数据库或文献的论据,可 以将细胞分裂膜基因基因可分临床意义明确(I 级)、有潜在临床意义(II级)、临床意义不明确(III 级) 和良性或可能良性基因( IV级) 。 Laboratory能够自建立分类及AO和研究课题新报告的 SOPs,SOPs 应将至少包括两 个各个方面:(1) 对细胞分裂膜基因基因开展AO的流程; (2)在日常员警查中会研究课题新报告哪一级或哪几级基因肽链。 AO的流程应将有历史纪录,包括的论据举例来说的同义南、文献、 数据库、的论据一般来说、AO在手果等。 临床的论据决定突 衰肽链AO,可根据《高通存量基因组新科技临床约束化 应将用北京专家共识》发表的细胞分裂膜基因肽链和临 床的论据可分所列 4 级。

对胚系基因的员警查

除了中会外诊疗同义南及 重要参阅文献外,另有 Online Mendelian Inheritance in Man (http:/ /omim.org)和新泽西州 ACMG 可参阅。 ACMG 同义南将衰异肽链禽流感的一般来说可分病毒性、疑 似病毒性、临床意义未明、起因于良性和良性 5 个一般来说。 研究课题新报告中会应将列出与遗传病在手腺癌(如 FAP、Lynch 综 合征等)关的的病毒性以及起因于病毒性衰异,并对衰异 的禽流感开展归纳解释[28] 。

意义不明肽链的东南侧理

无论是细胞分裂膜 基因,或是胚系基因,都普遍存在意义不明肽链。 考中验 室需制定关的政策用来具体是否研究课题新报告或者不研究课题新报告 临床意义不明的肽链,并附上陈述和参阅数据库, 并且要在研究课题新报告中会注明本Laboratory出具临床研究课题新报告的 规则。

DPYD 员警查在手果

中会等代谢型式病人,应将基于 活性加权纳高起始剂存量;慢代谢型式应将能避免运用于氟尿嘧 啶及其前体药物。 UGT1A1 员警查在手果中会,UGT1A1∗28 和∗6 为纯合衰异型式或双杂合衰异型式的病人应将纳高 伊立替康的剂存量,录用剂存量为 150 mg / m2 。

低丰度基因在手果的东南侧理

对员警验开展 NGS 员警 测出时如消失较高丰度的基因在手果( 往往解剖员警验小于 5%,尿液员警验小于 1%或小于员警查 LoD)时,自建 议综合同义标 NGS 考中验平台性能、基因组深度以及 细胞膜数目等诱因综合考虑。 之外对于靶向化疗都与 关的基因自决定运用于其他员警查方法有开展进一步验的证 获知(如 Sanger,dPCR 等)。

知情同意

自决定纳供病人副本或者在线版的知情著作。

研究课题新报告模板

Laboratory应将根据员警查自建设项目,给出对应将 的员警查研究课题新报告模板(表 7),并过渡到 SOP 文件。 模板中会 应将明确列出员警查研究课题新报告中会应将纳供的文档,如病人基本 文档、员警验文档、员警查文档、员警查在手果、在手果解释、亦非 验室文档、员警查方法有的局限性以及其他内容等。

原始出东南侧

我国抗癌协会靶向化疗专业秘书处.在手腺癌分子员警查高通存量基因组我国专家共识 .临床学杂志 2021 年 3 月第 26 卷第 3 期 Chinese Clinical Oncology,Mar. 2021,Vol.26,No.3

分享:
重庆整形医院/a> 济南整形医院 广州整形医院 宁波整形医院 深圳整形医院 整形医院排名 整形医院咨询 整形专业知识 济南整形医院 淘宝店铺买卖平台 快手买卖平台 抖音号出售 出售小红书网站 求购公众号途径 出售快手网 买卖小红书网站 小红书账号售卖 公众号过户网