NCBI []
NCBI (National Center for Biotechnology Information）是所指新泽西州国立生器皿技术所属单位
EMBL []
北美离子生器皿学科学研究室EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）
DDBJ []
DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年确立，是21世纪并列DNA 检索之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI检索都由组合成国际DNA检索
CNGB []
欧美第三21世纪检索（China National GeneBank）坐落于深圳大鹏新区，是继21世纪并列检索之后的全球第四大第三21世纪级检索。它是欧美首个，也是唯一一个第三21世纪遗传器皿质库，相对于全球另外三个遗传器皿质库而言，第三21世纪遗传器皿质库探针保留的规模、存储量和可访问的数据库量唯是全球最大。
BIGD []
欧美第三21世纪遗传器皿质组科学高容量 生命与健康大高容量 (National Genomics Data Center BIG Data Center)
2、非字符RNA检索（1）.非字符小RNA检索miRBase []
piRNAbank []
piRNAbank []
SILVA []
（2）.长非字符RNA检索：LncRNAdb []
酵母菌生器皿
LncRNAwiki [_Page]
有机体长非字符RNA检索
（3）.非字符RNA家氏族检索Rfam[]
类似于Pfam的RNA家氏族正文检索
（4）.非字符RNA核苷酸检索RNAcentral [ ]3、酵素质检索（1）.酵素质信息Human protein atlas [ ]
人体酵素在肝细胞、组织、病理条件下的理解
（2）.酵素核苷酸检索Pfam []
Pfam是酵素质家氏族的检索，还包括使用隐马尔可夫模型作用于的正文和多核苷酸鉴定。
SwissProt []
手动正文的非校验酵素核苷酸检索
UniProt [ ]
PIR []
Antibodies []
BRENDA [ ]
HPRD []
InterPro []
通过整合多个酵素关的检索，提供了一个方便的对酵素核苷酸进行功能正文的平台，还包括对酵素质家氏族、形态域、功能位点的预期
iProClass []
PRF []
REBASE []
（3）.酵素质形态检索PDB []
通过科学研究测定的形态
SCOP []
CATH []
PSI []
（4）.酵素组检索PRIDE []（5）.酵素质功能域检索PROSITE []
最全面
Pfam []
最各个领域
ProDom []
CCD []
Prints []
SMART [ ]
TIGRFAM []
（6）.酵素互作检索STRING []
DIP []
科学研究验证的酵素耦合检索
BioGRID [] ：
IntAct [ ]
4、肝细胞内检索MapMan：一个定制的肝细胞内途径检视和总编辑插件
（1）.肝细胞内途径检索KEGG []
GO []
NCBI BioSystems []
IMP []
plantCyc []
MANET [ ]
MetaNetX [ ]
（2）.肝细胞内组学经常用检索MataboLights []
HMDB []
YMDB []
ECMDB []
（3）.表型检索Planteome []
dbGaP []
IPPN []
5、核苷酸鉴定（1）.核苷酸与检索鉴定Blast []（2）.多核苷酸间鉴定Clustal（3）.核苷酸进化树分析方法MEGA6、遗传器皿质分析方法（1）.遗传器皿质信息GeneCard []
Gene Wiki[_Wiki ]
（2）.遗传器皿质正文Blast []
Interproscan []，
WEGO []
KAAS []
（3）.遗传器皿质功能预期：FGENESH []
AUGUSTUS [ ]
GENESCAN []
GeneMark []
Glimmer []
（4）.遗传器皿质形态预期Exon-Intron Graphic Maker []
根据候选遗传器皿质的外显子和内含子等信息绘制遗传器皿质形态
Blastp [_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome]
可的网站换取酵素形态域的正文和右方信息
（5）.同义遗传器皿质分析方法OrthoDB是直系同义器皿的综合目录[]（6）.亚肝细胞聚焦预期PSORT Prediction []（7）.启动子分析方法Plantcare []（8）.依赖性目的遗传器皿质的miRNA预期psRNAtarget []（9）.理解分析方法ArrayExpress [ ]
数据库来自EMBL的高通量功能遗传器皿质组学科学研究的数据库；
BAR []
在分析方法遗传器皿质功能时，通经常会简介遗传器皿质的理解Mode，即遗传器皿质在植器皿完全相同组织完全相同发育时期的理解丰度发生变化。通过的网站分析方法该网站BAR对候遗传器皿质进行理解分析方法。 是一个植器皿生信分析方法教育资源该网站，用该该网站分析方法遗传器皿质理解时，不仅可以赢取遗传器皿质理解Mode的热图，还可以赢取可视化的自旋荧光图片，直观呈现遗传器皿质在植器皿组织里的理解右方。
（10）.遗传器皿质形态绘制GSDS []
Gene Structure Display Server，基于遗传器皿质组正文明文绘制核苷酸遗传器皿质形态等功能
7、酵素质分析方法（1）.酵素二级三级形态预期及绘图CFSSP []SOPMA [_automat.pl?page=npsa_sopma.html]PredictProtein []SWISS-MODEL []（2）.酵素物理性质分析方法ProtParam []
酵素物理性质分析方法是所指酵素的一些器皿理和化学匹配，如离子量、等电点、和离子组合成、消光经常数、砹、不稳定经常数、脂肪氏族所比率、亲常。这些匹配，有助于进行酵素的关的生化科学研究。比如在体外体系（大肠杆菌、酵母等）理解和氢化目的酵素时，需要考虑到酵素的离子量、等电点、消光经常数、不稳定经常数和亲常等。在酵素活科学研究里，也需要根据这些匹配提高效率科学研究体系。
（3）.酵素相称常分析方法Protscale []
酵素的相称常主要由其侧链自由基R，如果R只是H或是C、H两元素组合成的话，都是疏水的，如果包含亲常侧链自由基，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是亲常的（鱼池的）。疏常有丝氨酸、色氨酸、天冬氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、丙氨酸和磷酸盐（甲硫氨酸）。疏常在酵素质内外，在持续保持酵素质的三级形态上，酵素和基质、HIV和抗原间的耦合等各种非共价键的离子相辅相成多方面，兼具举足轻重关键作用。
（4）.横跨鞘形态分析方法TMHMM []
酵素的横跨鞘形态分析方法对于预期酵素的亚肝细胞聚焦密切关的。如果兼具横跨鞘形态，酵素很或许聚焦于肝细胞里与鞘关的的形态，如肝细胞膜鞘、叶绿体鞘或线粒体鞘等内鞘系统。此外，酵素横跨鞘形态分析方法对于酵素功能分析方法也有一定的帮助。比如某酵素不能横跨鞘形态，但是亚肝细胞聚焦科学研究显示其可聚焦于鞘关的形态，这说明该酵素或许通过其他鞘聚焦酵素应征过去的。
（5）.频率肽分析方法SignalP []
峰频率右方为频率肽切割点，峰之前的核苷酸为频率肽
频率肽是所指随时随地新小离子的酵素质向新陈代谢通道转回的短肽链，经常坐落于酵素的N-尾端，负责把酵素质随时随地到完全相同鞘形态的亚肝细胞器内。字符新陈代谢酵素的mRNA在翻译时首先小离子N尾端的频率肽，它被频率肽识别酵素(SRP)所识别，SRP将核酸携带至肝肝细胞上，肝肝细胞鞘上的 SPR 受体识别并与之相辅相成。新小离子酵素在频率肽随时随地下进发肝肝细胞内南管，而频率肽则在频率肽酵素的关键作用下被切除术。由于它的随时随地，新生的就能够通过肝肝细胞鞘进入南管内，最终被新陈代谢到胞外。在寄生虫菌里理解索科利夫卡酵素时，可用频率肽随时随地索科利夫卡酵素聚焦新陈代谢到胞外，提高酵素可溶性，在原核理解系统（大肠杆菌、细菌杆菌等）和酵母菌理解系统（如毕赤酵母）里均有应用。
（6）.羧酸化位点分析方法NetPhos []
KinasePhos-2.0 []
酵素质羧酸化所指由酵素质嘌呤裂解的把 ATP 的羧酸基转回其实器皿酵素质残基（丝氨酸、赖氨酸、丝氨酸）上的每一次，或者在频率关键作用下相辅相成 GTP（通经常以 GTP 引入 GDP），是生器皿体内一种普通的通气方式，在肝细胞频率转导的每一次里起举足轻重关键作用。在频率降至时通过赢取一个或几个羧酸的公司而被激活，而在频率减弱都能去除这些的公司，从而失去活性。有时某个频率酵素羧酸化通经常引发下游的酵素由南向北发生羧酸化，形成羧酸化级联反应。
二、生器皿信息学插件及完整版元数据库：
Clustal:
MEGA:
MAFFT:
Sequence Matrix:
PGDSpider:
DnaSP v6:
Arlequin:
MapMan：
PartitionFinder:
jModelTest:
IQ-TREE:
IQ-TREE的网站:
RaxmlGUI:
Mrbayes 3.2.7:
PhyloSuite:
BEAST:
Figtree:
Tracer:
PopART:
Network:
Structure:
CLUMMP:
Distruct:
Migrate-N:
Phylonet: 或
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